برلین و هامبورگ بر سر پناه کلیسایی به چند افغان اختلاف دارند. گوتفرید مارتنز، کشیش برلینی، می‌گوید با وجود انتقادهای شهردار هامبورگ همچنان از پناهجویان حمایت می‌کند و حاضر است برای این کار به زندان برود اما آنها به افغانستان بازگردانده نشوند.
گوتفرید مارتنز کشیش کلیسای تثلیث در شتیگلیتس برلین در تازه‌ترین مصاحبه‌اش گفته است که او به افغان‌هایی که مرتکب چاقوکشی شده‌اند پناه نداده، بلکه به افرادی پناه داده است که به مسیحیت گرویده‌اند و بازگرداندن آنها به افغانستان، جانشان را در معرض خطر قرار می‌دهد.
پیش از این شهردار هامبورگ، شهردار برلین را به «سوءاستفاده سیستماتیک از پناه کلیسایی» متهم کرده بود. او گفته بود پولیس برلین از ورود به کلیسا و تفتیش آن خودداری می‌کند.
اختلاف میان هامبورگ و برلین بر سر سه شهروند افغان آغاز شد که ۱۰ سال پیش در سویدن مسیحی شدند، اما دولت سویدن بر آنها فشار آورد تا به افغانستان بازگردند. این سه نفر در سال ۲۰۲۴ سویدن را ترک کرده، ابتدا به هامبورگ رفتند، اما طبق توافق‌نامه دوبلین باید دوباره به سویدن بازگردانده می‌شدند.
آنها سپس به برلین رفتند و به کلیسای تثلیث شتیگلیتس پناه بردند که بزرگ‌ترین جامعه مسیحیان فارسی‌زبان در آلمان به‌شمار می‌رود.
معمولاً اولین کشور عضو اتحادیه اروپا که پناهجو وارد آن می‌شود، مسئول رسیدگی به پرونده پناهندگی اوست.
از میان ۱۷۰۰ عضو این کلیسا، هزار نفر ایرانی و ۴۰۰ نفر افغان هستند.
یک پناهجوی ۲۶ ساله افغان ده روز پیش که از ترس اخراج از سویدن به آلمان گریخت و در کلیسایی در برلین پناه گرفته بود، توسط پولیس بازداشت و به سویدن بازگردانده شد.
کلیسای برلین اخراج این پناهجو را معادل «صدور حکم قتل» در افغانستان دانست و اعلام کرد احتمال اخراج او از سویدن نیز وجود دارد.
کشیش مارتنز می‌گوید در ۸۰ درصد موارد، کلیسا درخواست پناه را رد می‌کند، اما جان این سه نفر در خطر است. اداره امور داخلی هامبورگ اعلام کرده که در سویدن تنها مجرمان به افغانستان بازگردانده می‌شوند و این سه نفر مجرم نیستند.